Niki Kjær Saabye kommer fra en stilling som kontorchef i Danmarks Nationalbank. Før da var han i tre år konsulent og rådgiver i Statsministeriet.
Niki Kjær Saabye har arbejdet i Danmarks Nationalbank i en årrække, blandt andet som kontorchef i Statistisk Afdeling med ansvar for værdipapir- og betalingsbalancestatistik. Niki Kjær Saabye har også i en periode været udstationeret i Den Europæiske Centralbank (ECB).